Балаганский район образован на основании Указа Президиума Верховного Совета РСФСР «Об образовании Балаганского района в Иркутской области» от 31 октября 1989 года, решением Иркутского областного Совета народных депутатов от 13 ноября 1989 года.

Балаганский районный народный суд  образован решением Балаганского районного Совета народных депутатов № 182 от 12.09.1990 года.

Организационными вопросами районного народного суда занимался отдел юстиции исполнительного комитета Иркутского областного Совета народных депутатов.

В связи с возложением на учреждения юстиции дополнительных функций и расширением их полномочий Постановлением Главы администрации Иркутской области от 23.03.1993г. Отдел юстиции преобразован в Управление юстиции администрации Иркутской области.

В соответствии со ст. 4 Федерального Конституционного закона № 1-ФКЗ от 31.12.1996г. «О судебной системе Российской Федерации» в судебную систему Российской Федерации входят федеральные суды, конституционные суды и мировые судьи. К федеральным судам отнесены, в том числе районные судьи. Таким образом, Федеральный Конституционный закон устранил понятие народного суда.

Управление Судебного департамента в Иркутской области создано во исполнение Федерального закона № 7-ФЗ  от 08.01.1998 г. «О судебном департаменте при Верховном Суде Российской Федерации» и Балаганский районный суд с 08.01.1998г. стал подчиняться Управлению Судебного департамента в Иркутской области.

Балаганский районный суд в пределах своей компетенции, рассматривает дела в качестве суда первой и второй инстанции и осуществляет другие  полномочия, предусмотренные Федеральным Конституционным Законом.

Районный суд является непосредственно вышестоящей судебной инстанцией по отношению к мировым судьям, действующим на территории соответствующего судебного района. 

Полномочия, порядок образования и деятельность районного суда устанавливается Федеральным Конституционным Законом. 

Первым председателем суда в Балаганском районном суде с момента  образования суда, т.е. с сентября 1990 года стал Постников Виктор Иванович и исполнял свои обязанности до марта 1991 года. С 1991 года по 2011 год председателем суда была Суховеркина Татьяна Владимировна. С 2004 года по 2022 год отправлял правосудие в Балаганском районном суде Прохоров Андрей Вадимович. В настоящее время назначен на должность председателя Нукутского районного суда Иркутской области. 

С момента образования суда и до 20 апреля 2020 года в суде работала главный специалист суда Первова Елизавета Гарифулловна. 

Районный суд имел расчетный счет в банке, две гербовые печати и два штампа. 

В 2003 году впервые была проведена экспертиза и научно-техническая обработка документов, отложившихся в делопроизводстве районного суда. 

В результате обработки были составлены: опись № 1, 2, 1-Л, историческая справка, титульные и под титульные листы. 

В опись № 1 дел постоянного хранения вошли годовые статистические отчёты по рассмотрению административных, уголовных и гражданских дел (ф.1 АП, 1,2), годовые статистические отчёты о материальном ущербе, причинённом преступлениями (ф.4). Отсутствовали годовые статистические отчёты о материальном ущербе за 1996-1998 годы.

Состав документов по описи неполный, были не включены приказы, т.к. все приказы по основной деятельности и по личному составу со дня образования суда, велись в одной книге, соответственно приказы включены в опись № 1-Л. Не вошли в опись статистические отчёты по рассмотрению гражданских дел за 1992 год, административных, уголовных, гражданских дел и о материальном ущербе, причинённом преступлениями за 1994- 1995 годы, т.к. не сохранены. Не отложились по делопроизводству годовые планы работы суда до 2000 года.  За 2000 год  за 1 – ое полугодие.  Годовой план работы суда и по кадрам за 2001 год велся в одной книге. 

Годовые отчёты  о составе и движении кадров по делопроизводству  за период 1990-2001 годы не отлагались.

Обзоры судебной практики по уголовным и гражданским делам отложились только за 1992 год.

В опись № 2 за 1990-1992 годы включены подлинные приговоры, постановления и решения по уголовным  и гражданским делам. По приговорам и решениям, по которым не истекли сроки хранения, оставлены  резервные номера. Гражданские дела единовременного исполнения до 1991 года регистрировались под индексом  «АЕ». К такой категории дел отнесены дела о взыскании алиментов и о взыскании заработной платы, остальные гражданские дела регистрированы под индексом «2».

В опись № 1- Л дел по личному составу за 1990-2001 годы были включены приказы по личному составу за 1990-2000 годы и за 2001 год, а также личные дела.

Личные карточки (ф.Т.2 и Т-2 ГС) до 2001 года не велись. 

Заработная плата судьям и работникам аппарата суда начислялась бухгалтерией Управления Судебного департамента в Иркутской области.

С 2010 года по 2012 год обязанности председателя суда исполнял Сокольников Николай Александрович. 

В 2012 году Степанюк Олег Владимирович был назначен председателем Балаганского районного суда Иркутской области.

С 2017 года по 2019 год исполнение обязанностей председателя суда было возложено на Сокольникова Николая Александровича. В настоящее время находится в почетной отставке.

28 июня 2019 года приказом Управления Судебного департамента в Иркутской области, Ещенко Александр Николаевич зачислен в штат Балаганского районного суда на должность председателя суда с 1 июля 2019 года. С 17 июня 2025 года Александр Николаевич находится в почетной отставке.

Приказом Верховного Суда Российской Федерации от 2 июля 2025 года временное исполнение полномочий председателя Балаганского районного суда Иркутской области было возложено на Кравцову Ольгу Александровну.

Указом Президента Российской Федерации от 6 октября 2025 года Кравцова Ольга Александровна назначена на должность председателя Балаганского районного суда Иркутской области.

Аппарат Балаганского районного суда на данный момент состоит из председателя суда, 1 должности судьи, помощника судьи, главного специалиста, секретаря суда, 2-х секретарей судебного заседания, архивариуса. 

На сегодняшний день Балаганский районный суд Иркутской области имеет необходимые условия для отправления правосудия, обеспечен компьютерами, оргтехникой, правовыми системами, государственной автоматизированной системой «Правосудие», программно-аппаратным комплексом «Фемида» для аудио- и видеофиксации судебного заседания, системой видеоконференцсвязи.